2010年2月21日，經國務院同意，衛生部、中央編辦、國家發展改革委、財政部和人力資源社會保障部印發了《關于公立醫院改革試點的指導意見》（以下簡稱《指導意見》）。《指導意見》明確了公立醫院改革試點的指導思想、基本原則、總體目標、主要任務、實施步驟、主要內容和組織領導。

　　《指導意見》指出，要完善醫院財務會計管理制度，嚴格預算管理和收支管理，加強成本核算與控制。積極推進醫院財務制度和會計制度改革，嚴格財務集中統一管理，加強資產管理，建立健全內部控制，實施內部和外部審計制度。健全財務分析和報告制度，加強公立醫院財務監管。建立健全公立醫院財務審計和醫院院長經濟責任審計制度，充分發揮會計師事務所的審計監督作用。

　　《指導意見》既是推進公立醫院改革試點的綱領性文件，也是五部委貫徹落實國辦發56號文件的重要舉措。《指導意見》對建立健全公立醫院財務審計和醫院院長經濟責任審計制度作出的規定，強調要充分發揮會計師事務所的審計監督作用，體現了國辦發56號文件“將醫院等醫療衛生機構、大中專院校以及基金會等非營利組織的財務報表納入注冊會計師審計范圍”的要求。隨著公立醫院改革的不斷深入，財政投入將不斷加大。如何確保其安全性、規范性和效益性必將成為一個廣受矚目的重要問題，在審計監督力量有所不及、單位內部審計難以完全奏效的情況下，應當充分發揮注冊會計師的專業特長和執業優勢，充分發揮會計師事務所的審計監督作用。同時，在健全醫院管理機制，強化內部控制方面，注冊會計師也能利用專業特長，提供有價值的咨詢服務。

　　廣大會計師事務所應當以《指導意見》的發布為重要契機，抓搶機遇，作好充分準備，深入研究醫院財務運行體制、內部運行機制、內部控制特點以及相關政策法規，為開展公立醫院審計和相關業務夯實基礎，為推進我國醫療衛生體制改革，提高財政資金科學化精細化管理水平作出應有貢獻。