福利企業是以安置有一定勞動能力的“四殘”人員勞動就業為主要目的具有社會福利性質的特殊企業，國家對福利企業給予了政策扶持，其中包括減免所得稅、營業稅和返還增值稅等稅收優惠。
國家稅務總局和民政部聯合下發《關于縣級以上民政部門對所舉辦的社會福利企業減免稅金提取問題的通知》（國稅發[1990]139號），對福利企業減免稅金會計處理作出規定：福利企業減免的稅金必須在企業賬目中設置“國家扶持基金”科目單獨列示，專賬管理。然而在實際操作中，現行的減免稅金的賬務處理仍存在不足。首先，現行《企業會計制度》中沒有“國家扶持基金”賬戶，福利企業的會計人員在進行減免稅金的會計處理時無所適從。其次，福利企業計算稅金和退還稅金并不在一個環節同時進行，而有關減免稅的會計處理規定并沒有考慮稅收的征收環節和退稅環節有機的銜接，造成福利企業相關會計處理五花八門，既不利于該項資金的監管，也違背了會計核算的明晰性原則。
為此，筆者建議明確福利企業免稅、退稅金的性質，理順會計處理。福利企業收到的免稅、退稅金應計入“資本公積”賬戶進行反映和監督，核算時在“資本公積”總賬賬戶下設明細賬戶“國家扶持基金”，具體反映該項資金的增減變動及結余情況。
《企業會計制度》規定，對于國家給予企業的各種補助，根據補助資金的不同性質，可作如下會計處理：如果該項資金屬于資本金投入性質，則應按《公司法》增資擴股的規定辦理相應的手續，在會計上屬于資本投入，計入“實收資本”或“股本”。如果該項資金屬于國家對企業的贈款，在會計上應增加資本公積，計入“資本公積”。如果該項資金屬于資金扶持，將來國家財政要收回，在會計上屬于負債，應計入“長期應付款”。如果該項資金屬于國家撥入的具有專門用途的撥款，應于實際收到時，計入“專項應付款”，撥款項目完成后，形成各項資產的部分，按實際成本轉入“資本公積”；未形成資產需核銷的部分，報經批準后，核銷“專項應付款”；撥款項目完成后，如有撥款結余需上交的，沖減“專項應付款”。如果屬于按銷量或工作量等和國家規定的補助定額計算并按期給予定額補貼以及屬于國家扶持的領域而給予的其他形式補助，應計入當期損益。
按照上述規定，筆者認為福利企業收到的免稅、退稅金應計入“資本公積”賬戶進行處理，理由有三：能夠明確該項資金的來源性質，該項資金實質上是國家對福利企業的無償投資，但從相關文件中規定的用途來看，國家并不作為投資人參與利潤分配，所以計入“資本公積”比計入“實收資本”更為妥當；能夠界定該項資金流入企業的時間，福利企業收到的免稅、退稅金，不是國家按計劃逐筆撥款先形成負債，以后再形成資本金，所以不需要通過“專項應付款”，而應在企業實際收到退稅款時直接計入“資本公積”；能夠做到專賬管理，如果該項資金計入當期損益，無形中會增加企業的凈利潤，凈利潤既有可能轉增資本，更有可能直接分配給投資人而改變了該項資金的用途，將其計入“資本公積”專戶單獨反映其使用及結余情況，便于專項資金的監督。
按稅種的不同，其具體的會計處理如下：
1.先征后返的增值稅：按稅法規定，除另有指定用途的項目以外，都應計入企業實際收到退稅或返還稅款年度的企業利潤，計算繳納企業所得稅。雖然福利企業所得稅在免予征收之列，但在計算時應考慮該因素對納稅所得額的影響。
企業收到退回的增值稅時，借記“銀行存款”，貸記“補貼收入”；期末，將“補貼收入”賬戶的余額轉入“本年利潤”賬戶，借記“補貼收入”，貸記“本年利潤”；將扣除所得稅后的補貼收入轉入“資本公積”，借記“本年利潤”，貸記“資本公積——國家扶持基金（減免增值稅）”。
2.減免的所得稅：一般采用直接減少應納所得稅額的辦法。
期末，按適用稅率和應納稅所得額計提應繳的所得稅時，借記“所得稅”，貸記“應交稅金——應交所得稅”；按減免稅額結轉減免的所得稅時，借記“應交稅金——應交所得稅”，貸記“資本公積——國家扶持基金（減免所得稅）”。
另外，福利企業在按規定用途使用該部分免稅、退稅資金后，應將這部分資金從“資本公積”（國家扶持基金）賬戶轉入“資本公積”（已用國家扶持基金）賬戶。
