有進出口經營權的商品流通企業（包括商業、糧食、外貿、物資供銷、醫藥商業、供銷合作社等），按其經營方式的不同，其進出口業務可以分為自營和代理兩大類。不同經營方式下的進出口業務，有關關稅會計處理的方法和內容也不相同。
進口業務關稅的會計處理
1、自營進口業務關稅的會計處理 商品流通企業自營進口業務，按規定計算應交納的進口關稅，借記“商品采購”科目，貸記“應交稅金——應交進口關稅”科目。實際交納時，借記“應交稅金——應交進口關稅”科目，貸記“銀行存款”科目。
2、代理進口業務關稅的會計處理 代理進口業務，對商品流通企業來說，一般不墊付貨款，多以收取手續費形式為委托方提供代理服務。因此，由于進口業務而應交納的關稅均由委托方負擔，商品流通企業即使向海關交納了關稅，也只是代墊或代付，日后仍要向委托方收回。商品流通企業代付進口關稅時，借記“應交稅金——應交進口關稅”科目，貸記“銀行存款”科目。向委托方托收時，借記“應收賬款”科目，貸記“應交稅金——應交進口關稅”科目。
