應付稅款由稅前會計利潤與納稅所得之間存在計算口徑和時間上的差異而導致的永久性或時間性差額，可以采用應付稅款法來處理公司應付所得稅。即將由于時間性差額對所得稅的影響，作為當期所得稅費用的增加或減少來處理，結果使得一定時期損益表中反映的所得稅金額與其所得稅前利潤相比，不等于當期的所得稅率。
采用應付稅款法核算，應設置“所得稅”科目，核算企業按規定從本期損益中扣除的所得稅，其借方發生額，反映企業計入本期損益的所得稅額，貸方發生額，反映轉入“本年利潤”科目的所得稅額。期末結轉本年利潤后，“所得稅”科目即無余額。
一般情況下，采用應付稅款法時，本期的稅款費用等于應付的所得稅，由于時間性差額對所得稅的影響金額不反映在賬戶上，只在會計報表的附注中加以說明。如，企業可按實際支付給職工的工資計入成本費用，但同時又給企業核定一個計稅工資總額，在納稅時，只能按不超過計稅工資總額從所得中扣除。在這種情況下，按計稅工資總額計算的納稅所得和按實際發放的工資總額計算的稅前會計利潤之間必然產生一個差額。在調整所得稅時，按照應納稅所得額計算的本期應付所得稅，作為本期的所得稅費用。
現舉例說明：
[例]某企業核定的全年計稅工資總額為150萬元，本年實際發放工資總額為200萬元，按會計核算的稅前會計利潤為1850萬元，該公司適用33％的所得稅率。根據上述資料，公司應作如下會計處理：
（1）納稅調整數＝200－150＝50（萬元）
（2）計算應納所得稅額：
＝稅前會計利潤＋納稅調整
＝1850＋50＝1900（萬元）
（3）計算應納所得稅額＝1900×33％＝627（萬元）
借：所得稅 627
貸：應交稅金——應交所得稅 627
從上例可見，在應付稅款法下，不管稅前會計利潤為多少，在計算繳納所得稅時均應按稅法規定對稅前會計利潤進行調整，再按納稅所得計算出應交的所得稅，計入所得稅科目。即無論企業采用哪種會計政策，對計入本期的所得稅費用不產生影響，影響的只是凈利潤部分。