（一）應納稅款的計算
稅法規定對個體工商業戶的生產經營所得的應納所得稅額是按年計算、分月預繳，年終匯算清繳，多退少補。
1、月份預繳所得稅的計算 .在月份預繳所得稅時，應將當月累計應納稅所得額，換算成全年應納稅所得額，根據換算的全年應納稅所得額，確定適用稅率，計算全年應納所得稅額，然后再換算出當月累計應納稅額，用當月累計應納稅額減去以前月份已預繳的稅款，即為當月應預繳的稅款。計算公式如下：全年應納稅所得額＝當月累計應納稅所得額÷當月月數×12；全年應納所得稅額＝全年應納稅所得額×適用稅率－速算扣除數；當月累計應納所得稅額＝全年應納所得稅額÷12×當月月數；當月應預繳所得稅額＝當月累計應納所得稅額－上月累計預繳所得稅額 .
例如：某個體工商戶1996年4月累計經營收入50000元，減除成本費用及損失后的應納稅所得額為10000元，1－3月已預繳所得稅1200元，計算該個體戶當月應預繳的個人所得稅。 先將當月累計應納稅所得額換算為全年應納稅所得額：10000÷4×12＝30000（元），用換算的全年應納稅所得額計算全年應納稅額：30000×20％－1250＝4750（元），計算當月累計應納稅額：4750÷12×4＝1583（元），計算當月應預繳所得稅額：1583－1200＝383（元）
2、年終匯算清繳所得稅的計算 .計算公式為：全年應納所得稅額＝全年應納稅所得額×適用稅率－速算扣除數 ，年終應補繳所得稅稅額＝全年應納所得稅稅額－分月預繳所得稅稅額合計數 ，計算的年終應補繳所得稅稅額為負數時為應退所得稅稅額。
例如：某個體工商戶1995年度所得稅匯算清繳后確定全年應納稅所得額為20000元，全年分月累計已預繳所得稅額2400元，計算年終應補（退）的所得稅額。 全年應納所得稅額為：20000×20％－1250＝2750（元），年終應補繳所得稅額為：2750－2400＝350（元）
3、個體工商業戶稅金計算的有關規定：（1）個體工商業戶與國有、集體、私營企業聯營，并分得利潤的，應在聯營企業所在地就分得的所得繳納個人所得稅。合并申報時，聯營分回利潤已納所得稅，可持完稅憑證從合并應納稅款中扣除。（2）個體工商業戶兼營種植業、養殖業、飼養業、捕撈業并對上述四業的所得單獨核算的，凡不屬于農業稅、牧業稅征收范圍的，應與其他行業的生產經營所得合并計征個人所得稅。（3）個體工商業戶兼有不同項目的應稅所得的，應就各項所得分別計征個人所得稅。在中國境內兩處以上取得個體工商業戶的生產、經營所得的，應合并計算個人所得稅。
（二）會計核算
月末計提應納個人所得稅時：
借：所得稅
貸：應交稅金──應交個人所得稅
實際繳納個人所得稅時：
借：應交稅金──應交個人所得稅
貸：銀行存款或現金
年終補繳個人所得稅時：
借：應交稅金──應交個人所得稅
貸：銀行存款或現金
收到退回多繳個人所得稅時：
借：銀行存款
貸：應交稅金──應交個人所得稅
年終轉帳時：
借：本年利潤
貸：所得稅