結算備付金是指證券公司為證券交易的清算交割而存入指定清算代理機構的款項。為分別反映公司為進行自營證券交易等業務的清算交割而存人指定清算代理機構的款項和公司代理客戶進行證券交易等業務的清算交割而為客戶存人指定清算代理機構的款項，“結算備付金”科目應設置“公司”和“客戶”兩個明細科目。
證券公司將款項存人清算代理機構，借記“結算備付金”科目，貸記“銀行存款”科目；從清算代理機構收回資金，借記“銀行存款”科目，貸記“結算備付金”科目。
[例]強盛證券公司為進行自營證券業務而存人指定的清算代理機構8 000 000元，為客戶代理買賣證券而存人指定的清算代理機構10 000 000元。
借：結算備付金——公司 8 000 000
——客戶 10 000 000
貸：銀行存款 18 000 000
公司接受客戶委托，通過證券交易所代理買賣證券，與客戶清算時，應分別以下兩種情況進行賬務處理：
1.如果買人證券成交總額大于賣出證券成交總額，按清算日買賣證券成交價的差額，加代扣代交的交易稅費和應向客戶收取的傭金等手續費，借記“代買賣證券款”科目，按公司應負擔的交易費用，借記“手續費支出——代買賣證券手續費支出”科目。按買賣證券成交價的差額，加代扣代交的印花稅費和公司應負擔的交易費用，貸記“結算備付金——客戶”科目，按向客戶收取的傭金等手續費，貸記“手續費收入——代買賣證券手續費收人”科目。
2.如果賣出證券成交總額大于買人證券成交總額，按清算日買賣證券成交價的差額，減代扣代交的印花稅費和公司應負擔的交易費，借記“結算備付金——客戶”科目，按公司應負擔的交易費用，借記“手續費支出——代買賣證券手續費支出”科目。按買賣證券成交價的差額，減代扣代交的交易稅費和應向客戶收取的傭金等手續費，貸記“代買賣證券款”科目，按應向客戶收取的傭金及過戶等手續費，貸記“手續費收入——代買賣證券手續費收入”科目。
[例] 強盛證券公司某日清算結果，共代理客戶買進證券150 000元，賣出證券200 000元，印花稅率0.2％，證券公司應負擔的交易費用為35元，應向客戶收取的傭金為1 225元。與客戶清算時，應作會計分錄如下：
借：結算備付金——客戶 49 265
手續費支出——代買賣證券手續費支出 35
貸：代買賣證券款 48 075
手續費收入——代買賣證券手續費收入 1 225
公司在證券交易所進行自營證券交易并清算時，應分別以下兩種情況進行賬務處理：
1.公司買人證券時，按清算日買人證券的實際成本（包括買入股票的成交價，加上交納的經手費、過戶費、證管費、印花稅等各項費用），借記“自營證券”科目，貸記“結算備付金——公司”科目。
2.公司賣出證券時，按清算日實際收到的金額，借記“結算備付金——公司”科目，貸記“證券銷售”科目；結轉已售證券成本時，借記“證券銷售”科目，貸記“自營證券”科目。
[例]強盛證券公司20×2年5月購買海華公司股票2 000股，實際成本：20 000元，應作會計分錄如下：
借：自營證券——海華股票 20 000
貸：結算備付金——公司 20 000
10月，公司售出該批股票，實際收到金額30 000元：
借：結算備付金——公司 30 000
貸：證券銷售 30 000
結轉自營股票實際成本：
借：證券銷售 20 000
貸：自營證券——海華股票 20 000
期末編制資產負債表時，“結算備付金”賬戶的期末余額應在資產負債表上列為“結算備付金”項目，并在該項目下單獨列示代理客戶買賣證券備付金的余額。