增值稅一般納稅人應在“應交稅金——應交增值稅”明細帳中設置三級明細科目，即應設置“進項稅額”、“已交稅金”、“轉出未交增值稅”、“銷項稅額”、“進項稅額轉出”、“出口退稅”和“轉出多交增值稅”科目。同時，根據國家稅務總局 [1998]44號文件精神，一般納稅人應在“應交稅金——應交增值稅”明細帳的借方增設“查補稅款”專欄，用以核算經自查或稅務機關檢查，并經稅務機關確認，已補繳以前月份或以前年度應繳納的增值稅稅款。
增值稅一般納稅人應按工業企業或商業企業等不同性質，分別設置基本的相關會計科目。
工業企業應設置的會計科目為：“材料采購”、“原材料”、“輔助材料”、“待攤費用——待抵扣進項稅額”、“制造費用”、“生產成本”、“產成品”、 “產品銷售成本”、“產品銷售收入”、“其他業務收入”、“銀行存款”、“現金”、“應收帳款”、“應付帳款”、“應交稅金——應交增值稅”和“應交稅金——未交增值稅”等科目。
商業企業應設置的會計科目為：“商品采購”、“庫存商品”、“待攤費用——待抵扣進項稅額”、“商品銷售成本”、“商品銷售收入”、“其他業務收入”、“銀行存款”、“現金”、“應收帳款”、“應付帳款”、“應交稅金——應交增值稅”、“應交稅金——未交增值稅”等科目。
下面，將有關增值稅稅收政策及近期政策調整與涉及到的增值稅一般納稅人購進貨物其進項稅額的確認和相關會計核算作一介紹。
按照《中華人民共和國增值稅暫行條例》第八條的規定，“納稅人購進貨物或者接受應稅勞務，所支付或者負擔的增值稅額為進項稅額”。在實際的經營活動中還包括接受投資和捐贈、進口貨物等，其進項稅額的確認有以下幾種含義：
一、購貨方購進貨物或者接受應稅勞務，從銷貨方取得的增值稅專用發票上注明的增值稅額，即增值稅專用發票上注明的“稅額”；
二、購貨方購進貨物不能取得增值稅專用發票時，以其實際支付的金額和法定的扣除率計算出進項稅額，如：購進免稅農產品、購進或銷售貨物所支付的運費等；
三、從海關取得的完稅憑證上注明的增值稅額。
[案例]某生產企業2002年3月6日購進一批原材料A，取得增值稅專用發票一張，發票上注明的原材料價款20000元，稅款3400元，以銀行存款方式支付貨款、貨未到；
3月9日從小規模納稅人企業購入生產用原材料B，取得普通發票一張，注明“金額”為10000元，貨款以銀行存款方式支付，貨己入庫；3月16日，原材料A到廠并已驗收入庫。
[案例分析]按照國家稅務總局的有關規定，增值稅一般納稅人購進貨物或應稅勞務，其進項稅額申報抵扣的時間按以下規定執行：
（一）工業企業購進貨物（包括外購貨物所支付的運輸費用），必須在購進的貨物已經驗收入庫后，才能申報抵扣進項稅額，對貨物尚未到達企業或尚未驗收入庫的，其進項稅額不得作為納稅人當期進項稅額予以抵扣；
（二）商業企業購進貨物（包括外購貨物所支付的運輸費用），必須在購進的貨物付款后才能申報抵扣進項稅額，尚未付款或尚未開出、承兌商業匯票的，其進項稅額不得作為納稅人當期進項稅額予以抵扣；
（三）一般納稅人購進應稅勞務，必須在勞務費用支付后，才能申報抵扣進項稅額，對接收應稅勞務但尚未支付款項的，其進項稅額不得作為納稅人當期進項稅額予以抵扣；
（四）增值稅一般納稅人中的商業企業采用分期付款方式購進貨物的。如果銷貨方每次是按合同約定的金額開具增值稅專用發票、購貨方按上述金額付足款項的，該筆進項稅額可以在當期申報抵扣。
（五）商業企業接受投資、捐贈和分配的貨物，以收到增值稅專用發票的時間為申報抵扣進項稅額的時限，在納稅人申報抵扣進項稅額時，應提供有關投資、捐贈和分配貨物的合同或證明材料。
（六）納稅人購進貨物或應稅勞務，或支付的運輸費用等，所支付款項的單位，必須與開具抵扣憑證的銷貨單位、提供勞務的單位一致，才能夠申報抵扣進項稅額，否則不予抵扣。
增值稅一般納稅人違反上述規定的，按偷稅論處，一經查出，則應從當期進項稅額中剔除，并在該進項發票上注明，以后不論其貨物到達或驗收入庫，或支付款項，均不得計入進項稅額申報抵扣。
根據上述政策規定，本案中的第一筆購進貨物（3月6日購進），因貨未到，且未驗收入庫，暫不能抵扣進項稅額，暫計入“待攤費用一待抵扣進項稅額”，待貨物驗收入庫后再轉入“應交稅金一應交增值稅（進項稅額）”中。具體會計分錄是：
3月6日，購進原材料A，貨物未驗收入庫：
借：材料采購——A 20000
待攤費用——待抵扣進項稅額 3400
貸：銀行存款 23400
3月16日，貨物驗收入庫：
借：原材料——A 20000
應交稅金——應交增值稅（進項稅額） 3400
貸：材料采購——A 20000
待攤費用——待抵扣進項稅額 3400
本案例中的第二筆購貨業務（3月9日購進），因從小規模納稅人企業購進貨物，盡管貨物已驗收入庫，按照政策規定，該企業所支付的款項全部計入材料成本中，具體會計分錄是：
3月9日，購進原材料B：
借：原材料——B 10000
貸：銀行存款 10000
若企業在驗收入庫時，發現貨物缺損，分別不同情況進行處理：
1.如果是定額內的合理損耗，即稅法中所說的“正常損失”，如：定額內的正常揮發等，此問題可以忽略不計，其進項稅額不用作轉出處理。
2，如果是非正常損耗或者是貨物丟失等，其相應的“材料采購”和“待攤費用——待抵扣進項稅額”不能轉入材料成本和進項稅額中，應根據實際情況或由保險公司、管理人員等進行索賠，或由銷貸方補足貨物或退款等，分別計入“其他應收款”、“銀行存款”等相關科目。
