由于增值稅實行憑增值稅專用發票抵扣稅款的制度，因此要求增值稅納稅人會計核算健全，并能夠準確核算銷項稅額、進項稅額和應納稅額。目前我國眾多納稅人的會計核算水平參差不齊，加上某些經營規模小的納稅人因其銷售貨物或提供應稅勞務的對象多是最終消費者而無須開具增值稅專用發票，為了嚴格增值稅的征收管理，《增值稅暫行條例》將納稅人按其經營規模大小及會計核算健全與否劃分為一般納稅人和小規模納稅人。
一、小規模納稅人的認定及管理
（一）小規模納稅人的認定標準
小規模納稅人是指年銷售額在規定標準以下，并且會計核算不健全，不能按規定報送有關稅務資料的增值稅納稅人。所稱會計核算不健全是指不能正確核算增值稅的銷項稅額、進項稅額和應納稅額。
根據《增值稅暫行條例實施細則》的規定，小規模納稅人的認定標準是：（1）從事貨物生產或提供應稅勞務的納稅人，以及以從事貨物生產或提供應稅勞務為主，并兼營貨物批發或零售的納稅人；年應稅銷售額在100萬元以下的；（2）從事貨物批發或零售的納稅人，年應稅銷售額在180萬元以下的。年應稅銷售額超過小規模納稅人標準的個人、非企業性單位、不經常發生應稅行為的企業，視同小規模納稅人納稅。
對小規模納稅人的確認，由主管稅務機關依稅法規定的標準認定。
（二）小規模納稅人的管理
小規模納稅人雖然實行簡易征稅辦法并一般不使用增值稅專用發票，但基于增值稅征收管理中一般納稅人與小規模納稅人之間客觀存在的經濟往來的實情，國家稅務總局根據授權專門制定實施了《增值稅小規模納稅人征收管理辦法》，規定：
1.基層稅務機關要加強對小規模生產企業財會人員的培訓，幫助建立會計賬簿。只要小規模企業有會計，有賬冊，能夠正確計算進項稅額、銷項稅額和應納稅額，并能按規定報送有關稅務資料，年應稅銷售額不低于30萬元的可以認定為增值稅一般納稅人。
2.對沒有條件設置專職會計人員的小規模企業，在納稅人自愿并配有本單位兼職會計人員的前提下，可采取以下措施，使兼職人員盡快獨立工作，進行會計核算。
（1）由稅務機關幫助小規模企業從稅務咨詢公司、會計師事務所等聘請會計人員建賬、核算。
（2）由稅務機關組織從事過財會業務，有一定工作經驗，遵紀守法的離、退休會計人員，幫助小規模企業建賬、核算。
（3）在職會計人員經所在單位同意，主管稅務機關批準，也可以到小規模企業兼任會計。
3.小規模企業可以單獨聘請會計人員，也可以幾個企業聯合聘請會計人員。
另外，財政部和國家稅務總局規定：從1998年7月1日起，凡年應稅銷售額在180萬元以下的小規模商業企業、企業性單位，以及以從事貨物批發或零售為主，并兼營貨物生產或提供應稅勞務的企業、企業性單位，無論財務核算是否健全，一律不得認定為增值稅一般納稅人。
二、一般納稅人的認定及管理
（一）一般納稅人的認定標準
一般納稅人是指年應征增值稅銷售額（以下簡稱年應稅銷售額，包括一個公歷年度內的全部應稅銷售額），超過增值稅暫行條例實施細則規定的小規模納稅人標準的企業和企業性單位（以下簡稱企業）。
下列納稅人不屬于一般納稅人：
1.年應稅銷售額未超過小規模納稅人標準的企業（以下簡稱小規模企業）。
2.個人（除個體經營者以外的其他個人）。
3.非企業性單位。
4.不經常發生增值稅應稅行為的企業。
（二）一般納稅人的認定辦法
增值稅一般納稅人須向稅務機關辦理認定手續，以取得法定資格。為此，1994年國家稅務總局專門制定實施了《增值稅一般納稅人申請認定辦法》，規定：
1.凡增值稅一般納稅人（以下簡稱一般納稅人），均應依照本辦法向其企業所在地主管稅務機關申請辦理一般納稅人認定手續。
一般納稅人總分支機構不在同一縣（市）的，應分別向其機構所在地主管稅務機關申請辦理一般納稅人認定手續。
2.企業申請辦理一般納稅人認定手續，應提出申請報告，并提供下列有關證件、資料：
（1）營業執照；
（2）有關合同、章程、協議書；
（3）銀行賬號證明；
（4）稅務機關要求提供的其他有關證件、資料。
上款第（4）項所列證件、資料的內容由省級稅務機關確定。
3.主管稅務機關在初步審核企業的申請報告和有關資料后，發給《增值稅一般納稅人申請認定表》，企業應如實填寫該表（一式兩份），并將填報的該表經審批后一份交基層征收機關，一份退企業留存。
《增值稅一般納稅人申請認定表》表樣，由國家稅務總局統一制定。
4.對于企業填報的《增值稅一般納稅人申請認定表》，負責審批的縣級以上稅務機關應在收到之日起30日內審核完畢。符合一般納稅人條件的，在其《稅務登記證》副本首頁上方加蓋“增值稅一般納稅人”確認專章，作為領購增值稅專用發票的證件。
“增值稅一般納稅人”確認專章印色統一為紅色，紅模由國家稅務總局制定。
5.新開業的符合一般納稅人條件的企業，應在辦理稅務登記的同時申請辦理一般納稅人認定手續。稅務機關對其預計年應稅銷售額超過小規模企業標準的暫認定為一般納稅人；其開業后的實際年應稅銷售額未超過小規模納稅人標準的，應重新申請辦理一般納稅人認定手續，符合下列第6條第一款條件的，可繼續認定為一般納稅人；不符合下列第6條第一款條件的，取消一般納稅人資格。
6.年應稅銷售額未超過標準的商業企業以外的其他小規模企業，會計核算健全，能準確核算并提供銷項稅額、進項稅額的，可申請辦理一般納稅人認定手續。
納稅人總分支機構實行統一核算，其總機構年應稅銷售額超過小規模企業標準，但分支機構是商業企業以外的其他企業，年應稅銷售額未超過小規模企業標準的，其分支機構可申請辦理一般納稅人認定手續。在辦理認定手續時，須提供總機構所在地主管稅務機關批準其總機構為一般納稅人的證明（總機構申請認定表的影印件）。
由于銷售免稅貨物不得開具增值稅專用發票，因此全部銷售免稅貨物的企業不辦理一般納稅人認定手續。
7.已開業的小規模企業，其年應稅銷售額超過小規模納稅人標準的，應在次年1月底以前申請辦理一般納稅人認定手續。
對于被認定為增值稅一般納稅人的企業，由于其可以使用增值稅專用發票，并實行稅款抵扣制度，因此，必須對一般納稅人加強管理，進行稅務檢查。根據 1995年1月國家稅務總局《關于加強增值稅征收管理工作的通知》規定，一般納稅人如果違反專用發票使用規定的，稅務機關應按稅收征管法和發票管理辦法的有關規定處罰；對會計核算不健全，不能向稅務機關提供準確稅務資料的，停止其抵扣進項稅額，取消其專用發票使用權；對某些年銷售額在一般納稅人規定標準以下的，如限期還不糾正，則取消其一般納稅人資格，按小規模納稅人的征稅規定征稅；納稅人在停止抵扣進項稅額期間所購進貨物或應稅勞務的進項稅額，不得結轉到經批準準許抵扣進項稅額時抵扣。
8.為了加強對加油站成品油銷售的增值稅征收管理，從2002年1月1日起，對從事成品油銷售的加油站，無論其年應稅銷售額是否超過180萬元，一律按增值稅一般納稅人征稅。
（三）一般納稅人年審和臨時一般納稅人轉為一般納稅人的認定
為加強增值稅一般納稅人（以下簡稱一般納稅人）的管理，在一般納稅人年審和臨時一般納稅人轉為一般納稅人過程中，對已使用增值稅防偽稅控系統但年應稅銷售額未達到規定標準的一般納稅人，如會計核算健全，且未有下列情形之一者，不取消其一般納稅人資格。
1.虛開增值稅專用發票或者有偷、騙、抗稅行為；
2.連續3個月未申報或者連續6個月納稅申報異常且無正當理由；
3.不按規定保管、使用增值稅專用發票、稅控裝置，造成嚴重后果。
上述一般納稅人在年審后的一個年度內，領購增值稅專用發票應限定為干元版（最高開票限額1萬元），個別確有需要經嚴格審核可領購萬元版（最高開票限額10萬元）的增值稅專用發票，月領購增值稅專用發票份數不得超過25份。
