⒈ 集中管理方式。這種形式把會計電算化工作，包括管理、開發和使用維護等都放在企業計算中心，財務部不設數據處理部門，也不安裝計算機設備。財務部門定期按規定向計算中心提供核算和管理所需的數據，由計算中心負責會計電算化的日常運行。在這種情況下，財務部門的組織機構一般不作大的變動，除了一些業務由計算機處理外，許多工作仍由手工來完成。這種方式有利于充分發揮計算機作用，提高數據共享程度，避免重復開發，也有利于企業統一領導、規劃和組織。
但是，集中管理也有很大的缺點:
第一 計算中心人員和財務人員不能很好地協作，各自不了解對方的知識和業務特點，各自偏重本單位情況，往往導致系統質量低，實用性較差等情況；
第二 各部門極易產生依賴思想，認為開展電算化工作是計算中心的事，從而不能很好地配合和支持系統的實施和運行，影響會計電算化工作的正常進行。
⒉ 分散管理方式。
在這種方式下，企業財會部門單獨配備計算機等設備，并配備一定的專業人員，會計電算化工作的實施，完全由財會部門負責進行，計算中心將不再參與。
分散管理的優點是：
第一 能調動財會部門的積極性；
第二 能根據財會部門的實際需要，分期分批解決急需電算化的項目，并且實用性強、投資少、見效快。
其缺點也是明顯的:
一是 缺乏整體考慮，各部門都可能從各自的目標出發，不考慮相互之間的聯系，數據不能共享，系統效益不高；
二是 各業務部門都需要配置計算機專門人員，否則影響系統實施，平時遇到的簡單問題及維護工作，都不能及時處理。
⒊ 集中管理下的分散組織形式。在這種形式下，企業設立專門的機構，統一負責全廠計算機應用規劃工作。規劃工作包括企業電算化的總體規劃，管理信息系統總體設計及子系統劃分，統一編碼，對所用機型等做出統一安排，指導各業務部門開展電算化工作，若企業已設立計算中心，專門機構的設置就可以以計算中心為主體設置。這種方式，既照顧了各業務部門的特點，又能統一管理組織，是目前一種較理想的組織形式。在這種方式下，實施會計電算化后，就需要調整財務部門的內部組織機構，崗位與職能都可能發生變化。
管理、開發、維護人員負責會計電算化工作的規劃，參與系統開發工作（如果自選開發的話），并負責日后的維護工作；數據準備人員負責電算化會計信息系統的運行工作、包括輸入、運行、輸出等工作；財務管理組負責一些財務日常管理工作（這些工作一般計算機難以直接處理），并參與企業的管理工作。
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