是事業單位發生劃轉撤并時，對一定時點上的事業單位的財產、債權和債務進行清理和核算，為財務管理體制和行政隸屬關系的變化奠定財務基礎。
分類 事業單位經國家有關部門批準，行政隸屬關系或財務管理體制發生變化時，應進行財務清算。具體的變化形式有：（1）劃轉。即事業單位因隸屬關系改變，成建制地在部門之間、上下級之間劃轉，它屬于事業單位行政隸屬關系的改變。（2）轉制。指事業單位轉為企業或事業單位在財務管理上由事業單位財務管理轉為企業財務管理。（3）撤銷。指事業單位終止運營。（4）合并。指兩個或兩個以上的事業單位進行合并。具體形式分為創立合并和吸收合并兩種。創立合并指合并后原有事業單位不復存在，形成一個新的事業單位；吸收合并指事業單位合并后，吸收方事業單位繼續存在，而被吸收方事業單位解散。
步驟 事業單位進行財務清算時，應當在主管部門和財政部門、國有資產管理部門的監督指導下，成立清算組。清算組一般由劃轉撤并的事業單位負責人和財務、審計、監察、物資、后勤、人事、工會等部門的人員組成，并需報經有關部門批準，在主管部門、財政部門和國家資產管理部門的監督指導下開展工作。清算組對清算期間的事業單位財務運行狀況負責。清算組應首先制定清算方案；然后對單位的財產、債權、債務等進行全面清理，編制財產目錄和債權、債務清單；提出財產作價依據和債權、債務處理辦法，作好國有資產的移交、接受、劃轉和管理工作，并妥善處理各項遺留問題。
清算結果的處理 劃轉撤并的事業單位清算結束后，經主管部門審核并報國有資產管理部門和財政部門批準，其資產分別按照下列辦法處理。
（1）因隸屬關系改變，成建制劃轉的事業單位，全部資產無償移交，并相應劃轉事業經費指標。
（2）轉為企業管理的事業單位，全部資產扣除負債后，轉作國家資本金。
（3）撤銷的事業單位，全部資產由主管部門和財政部門核準處理。
（4）合并的事業單位，全部資產移交接受單位或新建單位，合并后多余的國有資產由主管部門和財政部門核準處理。
