規范高等學校會計核算，保證會計信息質量的基本法規。現行《高等學校會計制度》自1998年1月1日起執行，共分為四部分。
第一部分，總說明。目的是為了適應社會主義市場經濟體制和規定學校各項事業發展的需要，為了規范學校會計核算，保證會計信息質量。依據是《中華人民共和國會計法和《事業單位會計準則（試行）》。適用范圍是各級人民政府舉辦的全日制普通高等學校、成人高等學校、普通中等專業學校技工學校、成人中等專業學校會計核算應采用借貸記賬法。記賬基礎是一般業務采用收付實現制，經營性收支業務采用權責發生制。記賬本位幣 是人民幣 ，發生外幣 收支的，應當折算為人民幣 核算。會計科目、賬簿等的設置要求。財務管理體制為“統一領導，分級管理”。
第二部分，會計科目。規定高等學校會計科目的設置，列示會計科目表及使用說明；會計科目按會計要素分為資產類、負債類、凈資產類、收入類、支出類和預算管理類等六類，共設置了50個會計科目。設置“預算收入”、“預算分配”、“預算結余”、“約定支付”、“約定支付準備”等5個表外科目。其中“預算收入”、“預算分配”、“預算結余”等科目之間有一定的對應關系，“約定支付”和“約定支付準備”科目有一定的對應關系。
第三部分，年終清理結算和結賬。規定結賬的期限和年終清理結算的主要事項。年度終了前，根據財政部門或主管部門的決算編審工作要求，對各項收支賬目、往來款項、貨幣資金和財產物資進行全面的清理結算。并在此基礎上辦理年度結賬，編報決算。
第四部分，會計報表。明確會計報表的屬性和作用。會計報表反映高等學校財務狀況和設置情況的書面文件。包括資產負債表、收入支出表、附表及財務情況說明書。會計報表的編制要求：數字準確，內容完整，報送及時，說明充分。規定報表的報送期限，月份報表應于月份終了后5日報出，季度報表應于季度終了后10日報出，年度報表應按主管部門規定的期限報出。
