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親愛的學員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復如下：
在土地增值稅清算時確認收入時不減契稅，是因為土地增值稅的計稅依據是轉讓房地產所取得的收入減去準予扣除項目的金額，而契稅屬于取得土地使用權時支付的費用，已包含在“取得土地使用權所支付的金額”中，作為扣除項目單獨列支。因此，契稅不應重復從收入中扣除。

具體解釋如下：

1.土地增值稅的收入確認：
土地增值稅的收入是轉讓房地產取得的全部價款，包括含稅收入。在計算時，需先將含稅收入換算為不含增值稅的收入，作為計稅依據。但契稅屬于取得土地時的稅費，與轉讓環節的收入無關，因此不從收入中扣除。

2.扣除項目中的契稅：
契稅屬于“取得土地使用權所支付的金額”中的一部分，與地價款、登記過戶費等一并作為扣除項目。這部分費用已在扣除項目中體現，無需再從收入中扣除，否則會造成重復扣除。

3.增值稅與土地增值稅的區別：
在增值稅中，允許扣除的土地價款不包括契稅，但土地增值稅的扣除項目中，契稅是作為取得土地成本的一部分單獨列支的。因此，契稅在土地增值稅中僅作為扣除項目，不涉及收入的調整。

綜上，契稅在土地增值稅清算中已作為扣除項目單獨列支，因此在確認收入時不需再減去契稅。
祝您學習愉快！