一是增值稅。對處理公司生產(chǎn)的產(chǎn)品或外購貨物取得的收入，仍按正常經(jīng)營方式進行增值稅處理：按處理公司生產(chǎn)的產(chǎn)品或外購貨物取得的收入法計提銷項稅，根據(jù)銷項稅減進項稅的余額繳納增值稅。對處置為已使用過的且已經(jīng)依法抵扣了進項稅的固定資產(chǎn)，以及處置使用過除固定資產(chǎn)以外的其他物品，應(yīng)當(dāng)按照適用稅率計提銷項稅；處置使用過的屬于不得抵扣且未抵扣進項稅額的固定資產(chǎn)，按簡易辦法4%征收率減半征收增值稅。需要說明的是：企業(yè)注銷清算時，對期初存貨中尚未抵扣的已征稅款，以及征稅后出現(xiàn)的進項稅額大于銷項稅額后不足抵扣部分，稅務(wù)機關(guān)不再退稅，也不得抵減清算過程中應(yīng)按簡易辦法征收的增值稅。

　　二是營業(yè)稅。對公司處置不動產(chǎn)，包括房屋、建筑物、構(gòu)筑物以及以及地面附著物，應(yīng)當(dāng)按“銷售不動產(chǎn)”項目繳納營業(yè)稅。轉(zhuǎn)讓土地使用權(quán)、商標權(quán)、專利權(quán)、著作權(quán)、商譽的行為，應(yīng)當(dāng)按“轉(zhuǎn)讓無形資產(chǎn)”項目繳納營業(yè)稅。

　　三是土地增值稅。對公司處置房屋、建筑物、構(gòu)筑物以及地面附著物及轉(zhuǎn)讓土地使用權(quán)取得的收入，應(yīng)當(dāng)依法繳納土地增值稅。土地增值稅就收入扣除準予扣除項目后的增值部分按規(guī)定的稅率計算征收。對轉(zhuǎn)讓舊房準予扣除項目的確定：轉(zhuǎn)讓舊房能提供評估價格的，根據(jù)財稅字[1995]48號文件的規(guī)定，轉(zhuǎn)讓舊房可扣除的項目金額包括三項，即舊房及建筑物的評估價格，取得土地使用權(quán)所支付的地價款和按國家統(tǒng)一規(guī)定繳納的有關(guān)費用，在轉(zhuǎn)讓環(huán)節(jié)繳納的稅金。此外，納稅人支付的評估費用準予在計算土地增值稅時扣除。轉(zhuǎn)讓舊房不能提供評估價格但能提供購房發(fā)票的，根據(jù)財稅[2006]號文件的規(guī)定，納稅人轉(zhuǎn)讓舊房及建筑物，凡不能取得評估價格，但能提供購房發(fā)票的，經(jīng)當(dāng)?shù)囟悇?wù)部門確認，可按發(fā)票所載金額并從購買年度起至轉(zhuǎn)讓年度止每年加計5%計算。對納稅人購房時繳納的契稅，凡能提供契稅完稅憑證的，準予作為“與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金”予以扣除，但不得作為加計5%的基數(shù)。即轉(zhuǎn)讓舊房不能提供評估價格，但能提供購房發(fā)票的扣除項目金額包括三項：購房發(fā)票所載金額（實際上包含了《條例》中六條的“取得土地使用權(quán)所支付的金額”以及“舊房及建筑物的評估價格”兩部分）：加計扣除金額（加計扣除金額=購房發(fā)票所載金額×5%×購買年度起至轉(zhuǎn)讓年度止的年數(shù)）：與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金（包括轉(zhuǎn)讓舊房時繳納的營業(yè)稅、城市維護建設(shè)稅、印花稅、契稅以及教育費附加，上述四稅及附加均必須提供相應(yīng)的完稅憑證）。轉(zhuǎn)讓舊房既沒有評估價格又不能提供購房發(fā)票的，根據(jù)財稅[2006]號文件的規(guī)定，對于轉(zhuǎn)讓舊房及建筑物，既沒有評估價格又不能提供購房發(fā)票的，地方稅務(wù)機關(guān)可以根據(jù)《稅收征管法》三十五條的規(guī)定，實行核定征收。

　　四是印花稅。對產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移證書，按所載金額萬分之五繳納印花稅。

　　五是企業(yè)所得稅。企業(yè)清算的核心是對企業(yè)財產(chǎn)（資產(chǎn)）的清理處置。稅法規(guī)定，企業(yè)將剩余財產(chǎn)分配給股東前要清算所得依法繳納企業(yè)所得稅。所以，企業(yè)清算期間的資產(chǎn)無論是否實際處置，一律視同變現(xiàn)，確認增值或者損失。確認清算環(huán)節(jié)企業(yè)資產(chǎn)的增值或者損失應(yīng)按其可變現(xiàn)價值或者公允價值進行計算。清算期間，企業(yè)實際處置資產(chǎn)時按照正常交易價格取得的收入可作為其公允價值。對于清算企業(yè)沒有實際處置的資產(chǎn)，應(yīng)按照其可變現(xiàn)價值來確認隱性的資產(chǎn)變現(xiàn)損益。計算清算所得，主要就是計算全部資產(chǎn)處置過程中產(chǎn)生的所得以及了結(jié)一切債權(quán)、債務(wù)所產(chǎn)生的所得或損失。此外，企業(yè)進行清算，即表明已終止持續(xù)經(jīng)營，是企業(yè)存在的最后一個過程。因此在計算清算所得時，還要考慮清算前企業(yè)尚未確認的遞延收益、尚未在稅前扣除的待攤費用、已在稅前扣除而不再實際支付的預(yù)提性質(zhì)的費用、商譽的扣除以及尚未超過彌補期限的虧損等問題。清算所得可用下面計算公式表示：清算所得=全部資產(chǎn)處置所得一清算費用+確實無法償還的債務(wù)一無法收回的債權(quán)損失+尚未確認的遞延收益一尚未扣除的稅前允許扣除的待攤支出+已在稅前扣除而不再實際支付的預(yù)提性質(zhì)的支出一商譽一以前年度發(fā)生的虧損。其中，全部資產(chǎn)處置所得=資產(chǎn)交易價格或可變現(xiàn)價值一資產(chǎn)計稅基礎(chǔ)一稅前允許的稅金及附加。稅前允許的稅金及附加，是指處置資產(chǎn)過程中繳納的營業(yè)稅、城建稅、教育費附加、印花稅、土地增值稅等，不包括可以抵扣的增值稅和企業(yè)所得稅，也不包含企業(yè)以前年度欠稅。清算所得稅的計算清算所得稅等于清算所得額乘以25%稅率。由于清算期間不屬于正常的生產(chǎn)經(jīng)營期間，在計算清算所得稅時不能享受有關(guān)企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。

　　六是個人所得稅。可供分配剩余財產(chǎn)，是指企業(yè)全部資產(chǎn)的可變現(xiàn)價值或交易價格減除清算費用、職工的工資、社會保險費用和法定補償金，結(jié)清清算所得稅、以前年度欠稅等稅款并清償企業(yè)債務(wù)后的余額。企業(yè)清算后，清算凈所得加上未分配利潤、公益金和公積金等，按一定比例分配給投資者，投資者分得剩余資產(chǎn)的金額，相當(dāng)于被清算企業(yè)累計未分配利潤和累計盈余公積中按該股東所占股份比例計算的部分，應(yīng)確認為股息所得，應(yīng)當(dāng)按“利息、股息、紅利”所得項目扣繳個人所得稅；剩余資產(chǎn)減除股息所得后的余額，超過股東投資成本的部分，應(yīng)確認為股東的投資轉(zhuǎn)讓所得，應(yīng)當(dāng)按“財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓”所得項目扣繳個人所得稅。

　　此外，需要說明的是：我國現(xiàn)行《破產(chǎn)法》第37條和《民事訴訟法》第204條均規(guī)定，破產(chǎn)財產(chǎn)在優(yōu)先撥付清算費用后，按下列順序清償：職工工資和勞動保險費用；所欠稅款；清償債務(wù)。對處于第二清償順序的“所欠稅款”是指企業(yè)清算前的欠稅，而并非是處置資產(chǎn)過程中的新發(fā)生的稅收。對清算處置資產(chǎn)時產(chǎn)生的稅收是為債權(quán)人的共同利益而于清算程序中必須支付的各種費用，是屬于清算費用，應(yīng)當(dāng)優(yōu)先受償。另據(jù)《稅收征管法》（第45條）：處于第二清償順序的欠稅發(fā)生在設(shè)立擔(dān)保債權(quán)之前的，稅收債權(quán)優(yōu)先；欠稅發(fā)生在設(shè)立擔(dān)保債權(quán)之后的， 擔(dān)保債權(quán)優(yōu)先。