營業稅的扣繳義務人主要包括：委托金融機構發放貸款的，其應納稅款以受托發放貸款的金融機構為扣繳義務人；建筑安裝業務實行分包或者轉包的，其應納稅款以總承包人為扣繳義務人；境外單位或者個人在境內發生應稅行為而在境內未設有機構的，其應納稅款以代理人為扣繳義務人；沒有代理人的，以受讓者或購買者為扣繳義務人；單位或者個人舉辦演出，由他人售票的，其應納稅款以售票者為扣繳義務人；個人轉讓專利權、非專利技術、商標權、著作權、商譽的，其應納稅款以受讓者為扣繳義務人及財政部規定的其他扣繳義務人。
值得注意的是：原分保險業務，其應納稅款以初保人為扣繳義務人。現在因為分保收入不再征收營業稅，所以初保人不再負有扣繳義務。此種業務收入應納營業稅，全部由初保人承擔。（見財稅字［1997］45號文件）。
上述扣繳義務人，按規定扣繳的營業稅，一律通過“應繳稅金一一應繳營業稅”科目核算。
例如：金融企業接受其他單位委托發放貸款，收到委托貸款利息，應記：
借：銀行存款
貸：應付賬款一一應付委托貸款利息
根據收到的貸款利息減去委托貸款的手續費計算代扣的營業稅，
借：應付賬款-應付委托貸款利息
貸：應繳稅金-應繳營業稅
代繳營業稅時，
借：應繳稅金-應繳營業稅
貸：銀行存款
再如：某建筑公司承包一項工程，總承包收入8000萬元，其中裝修工程2000萬元，轉下屬一分公司承建，其會計處理如下：
收到總承包款時，
借：銀行存款 80000000
貸：工程結算收入 60000000
應付賬款-分公司 20000000
計提營業稅金及代扣營業稅時，
應納營業稅＝（8000－2000）x3％＝180（萬元〕
應扣營業稅＝2000x3％＝60（萬元〕
借：工程結算稅金及附加 1800000
應付賬款-分公司 600000
貸：應繳稅金-應繳營業稅 240000
繳納營業稅時，
借：應繳稅金一一應繳營業稅 2400000
貸：銀行存款 2400000
