1.相關法律制度不完善。

　　目前已頒布的有關內部審計的法律依據主要是1994年頒布的《審計法》和2003年發布的《關于內部審計工作的規定》。根據《審計法》，國務院各部門和地方各級人民政府各部門、國有金融機構和企事業單位，應該按照國家有關規定建立健全內部審計制度，但并沒有要求民營企業必須建立健全內部審計制度。而審計署于2003年發布的《關于內部審計工作的規定》一項部門法規，其具體規定只適用于國有企業、事業單位。盡管非國有經濟組織開展內部審計工作，可參照本項法規的有關條款執行，但該規定畢竟只是部門規章，法律級次明顯偏低。民營企業發展到今天，無論是數量、規模和競爭力等方面都能與國有企業相提并論，同樣也需要加強內部控制和規范性運作機制。尤其是對于規模較大的民營企業而言，設立內審機構是十分必要和重要的，但是國家在民營企業如何建立完善內審機構，國家如何加強對民營企業內部審計的指導，缺乏具有可操作性的具體法律依據。對于如何加強對民營企業內審人員的管理，如何規范民營企業內審行為，提高內審工作質量，國家審計機關和內部審計協會都缺乏行之有效的管理辦法。可以說與民營企業相關的審計法規與制度建設嚴重滯后，使得民營企業內部審計難以建立高質量的運行機制。

　　2.管理層缺乏內部審計意識、重視程度不夠。

　　民營企業領導者的素質參差不齊，大多數領導人通過在市場上若干年的拼殺，在某些方面有所提高，但在文化水平、經營思想和理念以及管理水平等方面的素質還是相對較低。相當一部分民營企業主受自身素質和傳統觀念的束縛，再加上內部審計在我國的發展水平不高、社會上對內部審計宣傳不夠，導致他們對內部審計的重要性和必要性認識不清。他們認為內部審計的主要功能在于對于企業內部規章制度執行情況進行監督，并通過查找漏洞提供改進建議來促使企業提高效益，忽視了對包括風險投資與管理在內的價值增值審計。因此，他們過低地估計了內部審計創造的價值，忽視了內部審計創造價值的隱蔽性和長期性特征。有的民營企業雖然在國內、國外都有一定的知名度，但管理層尚不知道內部審計是怎么回事，認為企業是私有的，沒有必要設立內部審計。有的即使設立了內部審計機構，但卻存在負責人隨意撤并內審機構、精簡內審人員的情況，機構和人員的穩定性得不到保障，影響了內部審計工作的開展。民營企業內部審計是直接為企業服務的，企業內部審計的權力來自授權方，如果授權方給予較大的權限，內部審計就能發揮其作用。內部審計的效果如何,在很大程度上也取決于企業領導。如果企業領導人重視內部審計工作,就會對內部審計工作予以支持，內部審計人員的積極性就高，工作效果就好；反之,則差。研究表明，受當前民營企業管理層意識落后的影響，大部分民營企業內部審計的權力是有限的，這直接影響了內部審計作用的發揮。

　　3.內部審計機構設置混亂，審計獨立性較差。

　　民營企業發展很快，而相應地針對民營企業內部審計理論的研究卻滯后，民營企業內部審計的開展缺乏相應的理論指導。民營企業在設立內部審計機構時，有的是照搬國有企業，而有的是照搬西方企業，在照搬的過程中又沒有認真思考民營企業的內在特征，而是機械地套用，進而導致了內部審計機構設置上五花八門。有的將審計機構與財務部門合并，或在財務部門配備審計人員，有的與監察或保安部門混合設置，有的雖然設置了獨立的審計機構，但是與其他職能部門處于平行的地位；有的受董事會、監事會領導，有的受總經理領導，有的受財務總監領導等等，內審機構的獨立性和權威性得不到保障，企業內部關系不順、工作職責劃分不清、審計工作受阻，監督力度弱化。

　　4.內部審計職能定位較低。

　　西方的內部審計制度是企業為了生存、競爭和發展的需要而自發建立起來的。內部審計已從財務審計轉向管理型審計，并以管理審計為主導，其內部審計工作目標要求內審人員不僅要善于發現問題，而且更要善于解決問題。內部審計涉及的領域非常廣泛，內容相當深入。以美國為例，內部審計已廣泛開展了企業發展戰略和經營決策審計、投資效益審計、生產工藝審計、研究與開發審計、人力資源管理審計、后勤服務系統效率審計、信息系統設計與運行審計等。而民營企業內部審計則基本效仿國有企業內部審計的做法進行操作，其首要職能是監督，按照企業廠長（經理）的指令對本級各部門、下屬各分支機構的財務收支及其有關經濟活動進行監督。審計人員大多都將主要經歷放在財務數據的真實性、合法性的審查和監督上，而不是對管理做出分析、評價和提出管理建議。由于民營企業內部審計工作一開始便以“查錯糾弊”、“堵塞漏洞”等財務審計為主導，往往把被審計對象看作自己的“對立面”，很少以積極的方式提出問題、分析問題和解決問題，起點和定位都不高。隨著市場經濟體制的逐步發展和完善，企業的經營環境、經營規模、投資主體等都發生了變化，市場競爭越來越激烈，對內部審計也提出了更高的要求。如何防范經營和投資風險，如何降低成本，使企業在市場競爭中處于有利地位，如何加強財務核算和財務管理，提高經濟效益等等，這些都需要民營企業內部審計轉變單一的監督職能，增強服務職能，將內審工作的重點從傳統的“查錯防弊”逐步轉向富有建設性的經營管理審計上來，為企業的管理、決策及效益服務，切實發揮內部審計的作用。

　　5.審計人員素質較低、影響審計質量。

　　內審工作是一項專業性很強的工作，其質量的高低主要取決于內審人員的素質。隨著市場競爭機制的日趨完善，內審事業呼喚具有復合知識結構、能力強、綜合素質高、視野開闊的專業技術人才。要求內審人員要了解和掌握會計、審計、管理、科技、電子商務等方面的知識，熟悉相關的法律、法規等，而且應具有較強的專業技能和實踐經驗，有敏銳的洞察力和較強的判斷力，有較高的職業道德水平。但是民營企業大多是由最初的個體、合作企業發展而來的，發起人往往成為企業的主要高層管理人員，這些人大多文化水平較低。然而，由于我國民營企業家的“家族惰性”情懷以及中國人對財產固有的排他性,即使企業規模擴大，這些人仍然占據著企業高層管理位置，對于內部審計機構，其負責人也大多都是創始人或他們的親信，他們往往不懂審計，簡單地把審計看成是查賬，這不利于發揮內部審計為企業增加價值的作用，也就無法更好地領導內部審計工作。另外，由于對內部審計從業人員沒有嚴格的資質要求，很多內審人員來自財會部門或其他部門。有的審計人員還兼任其他職務，學歷層次低，缺乏必要的審計專業知識和技巧，從而難以適應審計工作的需要。內審人員的整體素質和專業技能有待提高。