保護和治理環(huán)境、遏制環(huán)境惡化，實現(xiàn)社會和經(jīng)濟可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略，是一項龐大而又復雜的系統(tǒng)工程，環(huán)境審計在這個系統(tǒng)工程中占有重要地位。不同審計主體實施的環(huán)境審計構(gòu)成不同層次環(huán)境管理系統(tǒng)的組成部分。因此，環(huán)境審計需要國家審計機關(guān)、內(nèi)部審計機構(gòu)和社會審計組織全方位、分層次地審查和評價被審單位環(huán)境保護法規(guī)和政策的執(zhí)行情況，環(huán)境保護和治理情況及取得的績效等，從而增強審計組織體系在解決環(huán)境問題中的整體功能。各審計主體實施環(huán)境審計時，應根據(jù)審計的目的和內(nèi)容以及自身的情況選擇審計模式。 

    (一)以財務為導向的審計模式 

    以財務為導向的審計模式是以被審單位環(huán)境財務報告反映的結(jié)果為線索，追蹤到經(jīng)濟活動過程和導致結(jié)果的原因，進而對環(huán)境保護的合規(guī)性和績效性進行評價的一種模式。環(huán)境審計是對與環(huán)境問題有關(guān)的經(jīng)濟活動進行的審計，而不能涵蓋環(huán)境的所有的問題。而經(jīng)濟活動進行的結(jié)果最終都要在財務資料中得到反映。這就為實施以財務導向的環(huán)境審計提供了可能。審計人員利用環(huán)境財務報告等資料，既可以對與環(huán)境有關(guān)的經(jīng)濟活動的財務狀況的真實性、合法性和合理性作出評價，又可以從不同側(cè)面對被審單位的環(huán)境績效作進一步剖析、比較和評價。在環(huán)境財務報告真實性、合法性和合理性的基礎(chǔ)上開展環(huán)境績效評價，既能滿足企業(yè)內(nèi)部管理當局需要，又能滿足企業(yè)外部經(jīng)濟關(guān)系人的需要，而且有利于節(jié)約審計成本，提高審計工作效率。 

    財務導向的環(huán)境審計方式，可以采用：(1)獨立審計，即由審計組織現(xiàn)有專職人員實施環(huán)境審計；（2)專題審計，即審計組織對某一內(nèi)容進行專題性的審計；(3)審計調(diào)查，即審計組織對影響環(huán)境的一些重大問題和典型問題進行審計調(diào)查活動。審計人員通過調(diào)查，廣泛收集證據(jù)，進行綜合分析，及時提供有關(guān)資料和建議，為政府和有關(guān)部門或有關(guān)單位服務。此外，也還可以采用其他的審計方式。 

    財務導向的環(huán)境審計方法有審閱法、驗證法、復算法、觀察法、分析法等。實際審計操作時，往往把這些方法綜合在一起加以運用，有選擇地針對具體審計目標和要求，運用各種方法多層次、多角度地對財務報告進行重新加工、比較、分析和評價。 

    從財務人手開展環(huán)境審計，可以對環(huán)境績效作出一般性的評價。而要全面地、客觀地評價環(huán)境保護和治理的績效，則需要等到環(huán)境成本、環(huán)境負債和環(huán)境效益能夠計量并能在會計資料上全面反映，要做到這一點，還需要一個相當長的時間。因此，以財務為導向的環(huán)境審計模式，目前主要用于環(huán)境審計中涉及屬于財務方面的內(nèi)容。當環(huán)境成本“內(nèi)在化”和“環(huán)境會計成本核算”建立之后，這時以財務為導向的環(huán)境審計就會上升到一個新的高度。 

    (二)以問題為導向的審計校式 

    以問題為導向的環(huán)境審計模式是以被審單位暴露的突出問題為線索，進行追蹤分析，攏出問題的形成原因，指出被審單位在環(huán)境保護和環(huán)境治理方面的薄弱環(huán)節(jié)，進而提出有針對性整改措施的一種審計模式。它通常適用于被審單位在環(huán)境方面發(fā)生重大事故和已暴露出的突出問題 (如決策失誤、嚴重污染或損失浪費自然資源等)。 

    審計人員可以從現(xiàn)存問題人手，進行調(diào)查取證，從大間題追到小問題，從表面問題追到潛在問題，從外部問題追到內(nèi)部問題。并按問題輕重主次排列分析，通過外因找到內(nèi)因，透過偶然因素我到必然因素，找出問題的主要方面，并與具體部門人員和其活動聯(lián)系起來，明確問題的性質(zhì)和經(jīng)濟責任。針對這些引發(fā)問題的因素，可以進一步提出消滅隱患、加強控制、改善管理、提高素質(zhì)的措施。如廢棄物排放造成環(huán)境污染已成為我國當前一個突出問題，而造成環(huán)境污染的最大根源在企業(yè)。企業(yè)污染環(huán)境，一方面影響企業(yè)在社會公眾中的良好形象，會使產(chǎn)品銷售長期受到不利影響，而且企業(yè)也會因此迫受罰款和發(fā)生更多的治理污染支出，給自己造成經(jīng)濟損失；另一方面會影響到其他企業(yè)、行業(yè)的正常生產(chǎn)經(jīng)營活動和人民的身心健康，給他們帶來經(jīng)濟損失；同時，國家為改善環(huán)境而必然在環(huán)境治理方面投入更多的資金，從而給國家?guī)斫?jīng)濟損失。因此，對企業(yè)因污染環(huán)境而造成的經(jīng)濟損失進行審計:審查企業(yè)污染環(huán)境的狀況和程度；分析企業(yè)污染環(huán)境所帶來的危害;我出引起污染的原因及因素；計算給被審企業(yè)、其他企業(yè)、人民和國家?guī)淼慕?jīng)濟損失。 

    以問題為導向的審計模式，由于涉及的問題多、影響因素多、專業(yè)性和技術(shù)性強，因此采用獨立審計方式往往難以達到審計目的和完成審計任務，而應采用審計調(diào)查和聯(lián)合審計的方式。聯(lián)合審計是在審計組織統(tǒng)一領(lǐng)導下，組織有關(guān)部門的專業(yè)人員進行環(huán)境審計。審計組織可以根據(jù)審計項目的需要，采取與環(huán)境專家和法學專家聯(lián)合審計的方式，以充分利用他們的專業(yè)知識和技能，對被審單位保護和治理環(huán)境的績效進行深入的審查。 

    (三)以項目為導向的審計模式 

    以項目為導向的審計模式是以被審單位涉及環(huán)境問題的重大業(yè)務為線索，對業(yè)務實施過程和結(jié)果進行檢查分析，判斷業(yè)務活動進行是否正常、是否收到預期效果，進而找出導致業(yè)務活動發(fā)生偏向的因素，提出改進措施的一種審計模式。 

    所謂重大業(yè)務，是指被審單位對環(huán)境有重大影響的活動。如環(huán)境規(guī)劃、重大決策、新建改造項目的實施等等。通過對重大業(yè)務活動的追蹤審計，能夠捕捉被審單位在環(huán)境保護和治理方面的薄弱環(huán)節(jié)，追查形成問題的原因，提出改進的措施。 

    人類環(huán)境保護的實踐證明，環(huán)境問題一旦發(fā)生后再進行治理，須補償?shù)拇鷥r將相當昂貴。有的不但涉及到內(nèi)補償，而且也關(guān)系到代際補償；有的環(huán)境污染和破壞問題出現(xiàn)后，即使經(jīng)濟上付出更大的代價，也往往難以清除和恢復。因此，預防環(huán)境污染和破壞比事后補償更重要。由此可見，環(huán)境審計不能僅僅停留于事后審計，而應對影響環(huán)境的主要經(jīng)濟活動的全過程進行審計，以保證決策正確，規(guī)劃可行，及時發(fā)現(xiàn)經(jīng)濟活動對環(huán)境的影響，采取保護環(huán)境的措施，最大限度地降低經(jīng)濟活動對環(huán)境質(zhì)量的不利影響。如對某些重要建設(shè)項目，事前應分析該項目對環(huán)境的影響及其程度，審查防治污染的處理工藝流程、預期效果，以及資源開發(fā)引起的生態(tài)變化所采取的防范措施、綠化設(shè)計、環(huán)境保護投資概算；車中審查施工現(xiàn)場周圍的環(huán)境保護、建設(shè)項目設(shè)計中的環(huán)境保護措施的落實等情況；事后審查施工過程中受到破壞的環(huán)境是否修整和復原，防治污染設(shè)施的運轉(zhuǎn)和使用情況，治理效果和達標情況等。 

    以項目為導向的審計模式，可以根據(jù)需要采用以上審計方式。至于在審計的方法上，除要運用財務審計和績效審計工作中使用的審閱、驗證、紅算、觀察、詢問、分析等基本方法外，還必須運用一些專業(yè)性的技術(shù)方法，才能更好地實施環(huán)境審計。在項目為導向的環(huán)境審計中需運用的專業(yè)性技術(shù)方法主要有：(1)環(huán)境費用效益分析法，這是用于分析評價解決環(huán)境問題的費用和效益的一種方法。這種方法主要用于擬建項目或已建項目對環(huán)境質(zhì)量的影響進行分析。運用這種方法的關(guān)鍵問題，是如何計算環(huán)境改善所帶來的效益以及環(huán)境污染、破壞所帶來的損失。常用的價值評估方法有：市場價值法、機會成本法、恢復的防護費用法、替代工程法、調(diào)查評估法等。環(huán)境費用效益分析評價指標有兩個：一是效益費用比率，二是凈效益；（2)環(huán)境費用效果分析法，這是在環(huán)境費用效益分析基礎(chǔ)上產(chǎn)生的一種新的分析方法。它主要有兩個用途:一是為達到某一確定的環(huán)境目標，選擇費用最低的方案；二是在投資一定的情況下，應選擇能最大限度改善環(huán)境質(zhì)量的方案。(3)環(huán)境決策分析法，是在一組可行的環(huán)境規(guī)劃方案中選擇最佳方案，并對這種方案作出解釋和證明。這種方法主要用于環(huán)境規(guī)劃績效審計。(4)風險分析法，是通過分析，預測各種不同確定因素的變化對經(jīng)濟指標和環(huán)境效益的杉咱，找出敏感因素，并確定其影響程度；根據(jù)各種因東發(fā)生的概率來計算評價風險對未來經(jīng)濟活動、環(huán)境效益的影響。